赵健元，国家自然科学基金委，“优秀青年基金”获得者， 2017

何吓俤，入选全国“博新计划”，2017

何吓俤，复旦大学学术之星特等奖，2017

赵世民，科技部创新人才推进计划“代谢与疾病”创新团队负责人， 2016

徐薇，入选中国科协首届“青年人才托举工程”，2015

赵世民“2015年上海领军人才”，上海市委组织部，2015

赵健元（第三完成人）“中国人群重大出生缺陷遗传分析” 自然科学奖，国家教育部，一等奖，2015

赵健元“新发突变致出生缺陷的发生机理”妇幼健康科学技术奖，妇幼健康研究会，一等奖，2015

赵健元“上海市优秀学位论文奖”上海市教育局、学位委员会，2014

赵世民“长江学者奖励特聘教授”，国家教育部，2013

赵世民“2013年度上海市优秀学术带头人”上海市科委，2013

赵世民“药明康德生命化学研究奖”，药明康德生命化学研究奖管理委员会，学者奖，2013

赵健元“罗氏奖学金”，罗氏，2013

徐薇，全国优秀博士学位论文提名，2013

徐薇，上海市优秀博士学位论文，2012

赵世民、赵国屏、王启军、余巍、雷群英、徐薇、林彦、蒋文卿 “代谢乙酰化调控机制的发现”，自然科学奖，国家教育部，一等奖，2012

赵世民“复兴医药奖”，复旦大学生命科学学院，特等奖，2012

赵世民“校园新星-科研新星”，上海市教育工会， 2011

赵世民“复旦大学优秀研究生导师”，复旦大学，2011

赵世民、管坤良、赵国屏、熊跃 “2010 年中国科学十大进展”，国家科技部，2011

赵世民、管坤良、赵国屏、熊跃 “2010 年中国高校十大科技进展”，国家科教育部，2011

徐薇，全国青联“中国青少年科技创新奖”，2011

徐薇，吴瑞奖学金，2011

徐薇，“Johnson & Johnson Asia Outstanding Graduate Thesis Award in Bio-tech”，Johnson & Johnson Corporate， 2011

赵世民“复兴医药奖”，复旦大学生命科学学院，2010

赵世民“明治乳业生命科学奖”， 明治乳业，杰出奖，2010

赵世民“谈家桢生命科学奖”，上海市医药协会，创新奖，2010

徐薇，复旦大学中国科学院奖学金，2010

徐薇，复旦大学博士优秀学生奖学金一等奖，2010

徐薇，复旦大学研究生学术之星，2010

赵世民“复兴医药奖”，复旦大学生命科学学院，2009

赵世民“医学前沿论坛论文奖”，中国工程院医药卫生部，一等奖，2009

徐薇，罗氏诊断奖学金，2009

赵世民“John Purdue 杰出研究生研究基金”，美国普度大学, 1998-2000